乡镇企业使用农民集体土地，按照下列程序审批：
（1）农村集体经济组织或者建设单位持有关建设项目批准文件，向市、县人民政府土地行政主管部门提出建设用申请；
（2）市、县人民政府土地行政主管部门对建设用地申请进行审查，提出审查意见；
（3）按照省、自治区、直辖市规定的批准权限，报县级以上地方人民政府批准，其中，涉及占用农有地的，应先按照《中华人民共和国土地管理法》第四十四条的规定办理农用地转用审批手续；
（4）建设用地经依法批准后，申请用地单位按照规定缴纳有关费用，占用耕地的，并履行开垦新耕地的义务；
（5）工程项目竣工后，由市、县人民政府土地行政主管部门对用地和开垦耕地情况进行检查验收，合格后办理土地登记手续，核发《集体土地使用并证》，确认建设用地使用权。
乡镇企业土地使用权如何办理？
一、乡镇企业用地使用权是经审批由农村集体经济组织通过投资方式向从事非农业经营性活动的乡镇企业提供的集体土地使用权。
二、农村集体经济组织办企业应当经县级以上人民政府批准。
三、申请取得乡镇企业用地使用权，涉及占用农用地的，应当按照《土地管理法》第44条的规定，办理农用地转用审批手续。其具体权限为，所申请的用地项目在依据土地利用总体规划和土地利用年度计划批准的农用地转用范围内的，由市、县人民政府批准；超出此范围的，由省、自治区、直辖市人民政府批准。
法律依据：《中华人民共和国土地管理法》第四十四条建设占用土_地，涉及农用地_转为建设用_地的，应当办理农_用地转批手续。
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