合作协议合伙协议的区别是协议涉及的内容不同。
1、合作协议是协议双方共同完成一个项目而临时组成的一个合作体，只针对某一个或多个项目，在项目完成后就自然解散；
2、合伙协议是协议双方共同投资而组成的一个实体，比如组成一个公司等，如果一方购买了另一方的股份或投资或其它的权益，该合伙协议也就没有了。
一、合伙协议内容包括哪些？
通常合伙协议应当载明下列事项：
1、合伙企业的名称和主要经营场所的地点
2、合伙目的和合伙企业的经营范围
3、合伙人的姓名及其住所
4、合伙人出资的方式、数额和缴付出资的期限
5、利润分配和亏损分担办法
6、合伙企业事务的执行
7、入伙与退伙
8、合伙企业的解散与清算
9、违约责任
10、合伙企业的经营期间和合伙人争议的解决方式。
二、公司合伙人都有哪些权利？
①合伙事务的经营权、决定权和监督权，合伙的经营活动由合伙人共同决定，无论出资多少，每个人都有表决权；
②合伙人享有合伙利益的分配权；
③合伙人分配合伙利益应以出资额比例或者合同的约定进行，合伙经营积累的财产，归合伙人共有；
④合伙人有退伙的权利。
三、合伙人应尽的义务有哪些？
①按照合伙协议的约定维护合伙财产的统一；
②分担合伙的经营损失和债务；
③合伙债务承担连带责任。
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