法律分析：保险公司应当按照保险合同的约定进行理赔，若拒绝理赔，则需要申请仲裁或提起诉讼进行维权。在此情况下，需要查看保险合同中是否有关于先天疾病的特别约定，并结合相关法规进行综合判断。
法律依据：
1.《保险法》第四十五条规定：保险人对于投保人提出的符合保险合同约定的保险金给付请求，应当及时处理，不得无故拖延。
2.《合同法》第二十八条规定：当事人订立合同，应当遵循公平、公正、诚信原则，不得以损害对方当事人利益为目的订立合同。
3.《医疗事故处理条例》第二十七条规定：保险公司应当按照保险合同的约定对被保险人进行赔偿。
综上所述，如果保险公司以脑损伤为先天疾病为由拒赔，可以通过申请仲裁或提起诉讼维护自己的合法权益。在审理过程中，需要查看保险合同的具体约定，并结合相关法规进行综合判断。